现在有许多主要来自法语分部（亦有来自葡语分部，英语分部，等等）的SCP报告， 均使用了一类被称为“威胁等级”的指标。这项指标通过考虑其不可预测性及造成破坏或人员（平民或基金会人员）伤亡的可能性，以表明异常所造成危险的严重程度。该指标可提供一快速有效的方法，用以评估SCP项目于其影响未被控制或未被制止的情况下可能造成的危险程度。
该指标为对项目等级所作补充，可用于确定SCP项目的收容难度。
与项目等级相同，同一异常的威胁等级亦可能发生改变。相关资料记载亦会作相应修改。
分级
基金会现采用以下各威胁等级，一一对应不同颜色：
白色威胁等级表示该SCP项目对基金会有利，例如支持基金会的活动、协助收容其余异常或保护人员。不过，项目的使用受严格管制，且须严格遵守对象之特殊收容措施。
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蓝色威胁等级表示该SCP项目可能对基金会有益，但由于其不可预知性或限制性太大，例如激活条件过于具体或性质过于随机，而无法以标准方式使用。
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绿色威胁等级表示该SCP项目无论是否遵循其特殊收容措施，均不会造成直接的危险或益处。然而，根据使用或接近项目的不同方式，其可能会间接造成有益或有害的后果。
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黄色威胁等级表示该SCP项目可能具有危险性但易于控制。例如，若该异常在满足某些激发条件前保持稳定，或者即使处于激发状态，亦可以通过严格执行特殊收容措施而轻松加以控制，则属于该等级。
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橙色威胁等级表示该SCP项目可能具有危险性，有时难以预测，且不易控制。该等级亦是对具智能的实体所规定的最低威胁等级，因为此类实体具有改变行为并进行调整，以绕开特殊收容措施的限制或欺骗工作人员的能力。
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黑色威胁等级表示该SCP项目可造成全球甚至更大规模的破坏。此类对象的收容突破直接等同于一次K级情景，应被视为绝对优先事项。
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未确定威胁等级表示该SCP项目的危险性无法被确定，或其威胁的可变性或模糊性过大，因而不具备相关性。
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格式
在SCP报告中，威胁等级后均附有一彩色圆点。若须添加彩色圆点，请使用以下格式：1
| 白 ● 蓝 ● 绿 ● 黄 ● 橙 ● 红 ● 黑 ● |
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